Iako mnogo olakšava čišćenje posuđa nakon pripreme hrane, papir za pečenje sve češće pokreće pitanje da li je potpuno bezbedan za zdravlje imajući u vidu naučne pretpostavke koje povezuju njegov sastav sa potencijalnim zdravstvenim rizikom.
Papir za pečenje se pravi od celuloze i prolazi dodatnu obradu kako bi bio otporan na vlagu, masnoću i visoke temperature. Najčešće je premazan silikonom koji sprečava lepljenje hrane i čini papir pogodnim za pečenje na visokim temperaturama.Ipak, izbeljivanje hlorom može dovesti do stvaranja dioksina, jedinjenja koje Svetska zdravstvena organizacija klasifikuje kao kancerogene za ljude. Iako se nalaze u veoma malim količinama, pri izlaganju visokim temperaturama mogu preći u hranu a jednom uneti u organizam, zadržavaju se u masnom tkivu godinama i povezani su sa hormonskim poremećajima, smanjenom plodnošću i oštećenjem jetre. Takođe, većina papira za pečenje ima silikonski premaz, koji je deklarisan kao bezbedan za hranu ali neka istraživanja pokazuju da se tokom pečenja, naročito pri temperaturama višim od preporučenih, mogu osloboditi siloksani koji se dovode u vezu sa hormonskim poremećajima.
Iako upozorenja nisu alarmantna, treba biti oprezan. Prvo i osnovno pravilo za bezbedno korišćenje papira za pečenje je njegova isključivo jednokratna upotreba. Naime, nakon jednog pečenja, premaz koji papir za pečenje sadrži može početi da puca i ispušta čestice. Zato većina proizvođača uz jednokratnu upotrebu preporučuje i maksimalnu temperaturu od 220–230 °C jer iznad toga raste rizik od razgradnje silikona i mogućeg prelaska štetnih materija u hranu. Evropska agencija za hemikalije (ECHA) klasifikovala je neke oblike siloksana kao supstance veoma visokog rizika (SVHC) pa je to još jedan razlog za izbegavanje višekratnog korišćenja papira za pečenje.
Alternativa papiru za pečenje je podmazivanje sa malo ulja ili upotreba posuda od nerđajućeg čelika koje su dugotrajne, nereaktivne i jednostavne za čišćenje. Keramičke i posude od vatrostalnog stakla su takođe dobra opcija za pečenje hrane ali, kao za papir i sve drugo što koristimo u domaćinstvu, uvek treba uzimati stvari sa potvrđenim sertifikatima bezbednosti.
